Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2587850	2587861	12	69 [0]	[0] 20	mdtE	multidrug resistance efflux transporter

CAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGA  >  minE/2587862‑2587923 |                                                              cAGCGTATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:2460550/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATGTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGACg                           >  1:2045211/1‑37 (MQ=38) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGt                      >  1:2012772/1‑42 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCt    >  1:2232318/1‑60 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCt    >  1:2401740/1‑60 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTg   >  1:2751086/1‑61 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:964098/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:1309183/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:95615/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:699931/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:450547/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:406489/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:308395/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:2474860/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:2269926/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:2212222/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:1965506/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:1937784/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:155457/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCAGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:801138/1‑62 (MQ=255) |                                                              CAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGA  >  minE/2587862‑2587923

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑