Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2588831 2588853 23 58 [0] [0] 84 gadE DNA‑binding transcriptional activator

CTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAC  >  minE/2588854‑2588914
|                                                            
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTTGAc  <  1:117764/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2826035/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:3120463/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:3084337/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:3040032/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:3006992/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2990517/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2926653/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2916754/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2876618/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2873996/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2837135/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:3193929/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2798047/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2795027/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2764855/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2738140/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2677102/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2660153/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2616595/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2591074/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:257542/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:687364/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:973210/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:949810/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:94758/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:942512/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:937879/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:92208/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:843397/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:840891/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:795922/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:735920/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:3130622/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:657974/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:557140/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:535109/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:530599/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:464806/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:42780/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:341490/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:326030/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2574514/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1569270/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1884653/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:180143/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1793315/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1751544/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1749199/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1743963/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1734600/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1733121/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1686756/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1658655/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1960985/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1517527/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1456843/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1330679/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1247198/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1231516/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1226883/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1181460/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1170198/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1132412/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2315419/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2549174/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2536926/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2523341/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2521402/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2517761/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2446778/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2427882/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2382507/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2366153/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1086408/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2313412/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2311074/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2265069/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2256031/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2140614/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2133749/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2108402/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:1994740/61‑1 (MQ=255)
cTTGTACATAATGTTGAAGTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAc  <  1:2110324/61‑1 (MQ=255)
|                                                            
CTTGTACATAATGTTGAATTTCTGAATCTTTAATGTTTGTTGCGAAATATTGAGCGTCGAC  >  minE/2588854‑2588914

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: