Missing coverage evidence...
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AGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATGCG  >  minE/2603946‑2603987 |                                          agcagcAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1578354/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAg         >  1:495548/1‑35 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:3208730/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2582499/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2681110/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2787273/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:279628/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2841758/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2974011/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2980458/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2984251/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:3202883/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2446987/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:448461/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:477700/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:643756/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:680501/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:736695/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:888119/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:938588/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1609101/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1053640/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1066198/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:111810/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1229677/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1258620/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1351493/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:155172/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1561003/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1579231/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2511625/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1647711/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1775291/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:1944303/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2043106/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:209054/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2107688/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATgcg  >  1:2356392/1‑42 (MQ=255) aGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGAGCATCAGCCATgc   >  1:1020526/1‑41 (MQ=255) |                                          AGCACCAGATTGGCGACTTCTACGTTGTGCATCAGCCATGCG  >  minE/2603946‑2603987

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑