Missing coverage evidence...
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ATTATTTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAC  >  minE/2605829‑2605890 |                                                              attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2985036/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1075623/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2410326/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:249013/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2521168/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2522738/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2537988/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2653726/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:268171/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2858716/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2384294/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:3297468/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:362540/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:479535/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:556302/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:561099/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:847336/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:861348/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:900657/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2048150/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1123397/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1146800/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1163026/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1293283/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1329929/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1442461/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1451689/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1498149/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1627739/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1664824/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1681761/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1709518/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1715980/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1802399/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:1982408/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2027430/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:2222347/62‑1 (MQ=255) attattTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCACCACTAc  <  1:373869/62‑1 (MQ=255) attattATGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAc  <  1:3044090/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATTATTTTGGGCTTTATGTGTCGTTTGCATTGTTAACATGGCGCGCTATTTCTCATCACTAC  >  minE/2605829‑2605890

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑