Missing coverage evidence...
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ACACATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAG  >  minE/2608424‑2608484 |                                                             acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTTGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:230298/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2750749/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2299072/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2325268/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2443844/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:251639/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2683924/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2692655/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2703925/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2732185/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:954517/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2799/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:3051561/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:30523/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:3272110/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:491228/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:51774/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:518958/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:883382/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1052287/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2267316/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1218760/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1239014/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1259870/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1324894/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1326241/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1335101/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1343851/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1387656/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1491681/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1582547/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1608547/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1612569/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:1749313/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:199362/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:224094/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2254140/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2254678/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:2275252/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCGCTTGCGCCAg  <  1:1247278/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCATCTTGCGCCAg  <  1:2800277/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGATGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:865801/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTACCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:383699/61‑1 (MQ=255) acacATACGACAGCACCGCGAAACCTAGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAg  <  1:3049468/61‑1 (MQ=255) |                                                             ACACATACGACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAG  >  minE/2608424‑2608484

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑