Missing coverage evidence...
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AAGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGC  >  minE/2611659‑2611721  |                                                              aaGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCT‑GCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2744654/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCTAGATGc  <  1:3057089/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2777565/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:924552/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:83589/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:540226/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:537207/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:507450/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:457164/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:409548/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:3273450/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:3250233/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:3140829/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:3107042/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2864094/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2811098/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:1270267/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2686911/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2454009/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2451167/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2345875/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2253170/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:2175584/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:193052/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:1890388/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:1604290/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:1418835/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:1278706/62‑1 (MQ=255)  aGTTCAGCATATCGTCAAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGc  <  1:1535762/62‑1 (MQ=255)  |                                                              AAGTTCAGCATATCGTCCAGTACCGGGCGTTGGCTGGCGAATGAGATACCAAAGTCAAGATGC  >  minE/2611659‑2611721

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑