Missing coverage evidence...
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GAATAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTA  >  minE/2638749‑2638811  |                                                              gAATAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGA‑GGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:473336/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTTGACGGCGGTATTGAGCTTCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:2210331/62‑1 (MQ=39)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:359003/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:224002/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:234308/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:2344142/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:2617575/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:2880748/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:302351/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:3209637/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:2226185/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:363157/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:479753/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:566882/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:669472/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:72703/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:868755/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:95932/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1936530/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1803725/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1800995/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1736844/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1734083/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1667534/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1611457/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1578791/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1539190/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1512845/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1445890/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1361314/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:11571/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1102752/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1045145/62‑1 (MQ=255)  aaTAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGAAGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTa  <  1:1033806/62‑1 (MQ=255)  |                                                              GAATAACGAAGGCACGCATTTCGAACTGGACGGCGGTATTGAGCTGCCGCTAAACGGTGGCTA  >  minE/2638749‑2638811

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑