Missing coverage evidence...
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TTGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTCC  >  minE/236251‑236306 |                                                        ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCGGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:809735/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:3238516/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2447983/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2517377/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2536634/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2689173/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2701239/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2780542/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2799374/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:3031158/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:3061774/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:3064639/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:3088217/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:3183511/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:3210315/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1282174/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:352689/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:369396/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:464561/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:500124/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:574518/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:624265/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:725781/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:758025/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:839508/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:847593/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:848611/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2434893/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1161537/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1318969/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1384498/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1474762/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:149455/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1617808/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1633707/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1638323/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1661807/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1703514/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1711483/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1739641/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1803844/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1861793/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1880447/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:189599/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:1902808/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2024123/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2033253/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2222537/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2244287/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2305914/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2324990/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2338183/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2362819/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTcc  <  1:2439862/56‑1 (MQ=255) ttGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGGGGGGGTTATCGTTcc  <  1:89923/56‑1 (MQ=255) |                                                        TTGCCTCCACTGGTTTCCTCTATTGTTGAAGATCATCAGGTGGGGGTTATCGTTCC  >  minE/236251‑236306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑