Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2651355	2651396	42	20 [0]	[0] 43	glgX	glycogen debranching enzyme

CGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCA  >  minE/2651397‑2651456 |                                                            cGCTGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2288528/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTCATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:3122003/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:3115663/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2511743/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2524505/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2540190/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2554266/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:257647/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2633269/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2693079/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:288991/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2968766/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2466443/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:3208402/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:448501/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:511488/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:69019/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:736399/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:800134/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:811784/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:819840/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:915040/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1997393/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1329812/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1391101/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1436470/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:149629/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1581913/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1643596/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1766379/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1973242/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1977717/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1985324/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2507696/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2016097/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2094766/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2272582/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2301127/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2320382/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2381870/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:2396303/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:241284/60‑1 (MQ=255) cGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCa  <  1:1085511/60‑1 (MQ=255) |                                                            CGCAGGCAAGCAGTGGTTTAACCGCATTTACCGCCGCGTTAATCCATCTGCGCAAGCGCA  >  minE/2651397‑2651456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑