Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2659969	2659972	4	30 [0]	[0] 60	glpG	predicted intramembrane serine protease

ATGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAACAC  >  minE/2659973‑2660033 |                                                             aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCAt              >  1:1654444/1‑49 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTc            >  1:2629487/1‑51 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGa          >  1:2506951/1‑53 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGa          >  1:2919309/1‑53 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:402462/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2464553/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2476216/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2496187/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2673361/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2740423/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2803538/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2850843/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:292649/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:3047502/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:3207643/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:3263546/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:363942/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2405952/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:435340/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:485987/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:572207/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:633286/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:667456/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:716599/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:743035/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:769323/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:782189/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:800450/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:886608/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:887795/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:936069/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1934095/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1108526/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1129645/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:113111/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1165249/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1241928/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1258063/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1382936/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1576412/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1579808/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1606640/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1788921/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1840162/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1856867/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1050973/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1938401/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1956817/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2072291/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:20784/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2098403/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2153301/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:21697/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:231562/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2334227/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:23700/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2399190/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATCCGATCCAacac  >  1:1973653/1‑61 (MQ=255) aTGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTCGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:1164535/1‑61 (MQ=255) aTGAAAATTCTCGGCGCTCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAacac  >  1:2029960/1‑61 (MQ=255) |                                                             ATGCAAATTCTCGGCGATCAGGAAGTGATGTTATGGCTGGCCTGGCCATTCGATCCAACAC  >  minE/2659973‑2660033

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑