Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2661272	2661287	16	114 [0]	[0] 17	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

TATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCT  >  minE/2661288‑2661330 |                                           tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:265208/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:859893/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:801656/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:3217435/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:3215947/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:3142965/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:3053008/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:3023606/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:2704587/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:1806717/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:2541261/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:2249212/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:206668/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:1984006/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:1968733/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:1916050/43‑1 (MQ=255) tATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCt  <  1:1831156/43‑1 (MQ=255) |                                           TATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGACGCTGGCTTTGCCCT  >  minE/2661288‑2661330

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑