Missing coverage evidence...
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CTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCG  >  minE/2675272‑2675332 |                                                             cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:3151167/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2775034/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2875154/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2900619/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2934783/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2965502/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2995488/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:3007884/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:3051808/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:3056004/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:3133750/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:27361/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:3241365/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:360782/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:36354/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:50832/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:519316/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:885176/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:896342/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:905007/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:962388/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1969413/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1333842/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1504630/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1553547/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1712743/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1717052/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1782614/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1830550/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1881389/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1189693/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:1983713/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:204642/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2100741/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2123521/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2175155/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2306249/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2653881/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2656173/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCg  <  1:2726233/61‑1 (MQ=255) cTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGGGGCTTCCACAGCg  <  1:175934/61‑1 (MQ=255) |                                                             CTCATCAACATACGCGGTCAGCAGGTCAAATTTCAGGGCTGTGTCGGTGGCTTCCACAGCG  >  minE/2675272‑2675332

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑