Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2685283	2685286	4	17 [0]	[0] 22	envZ	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with OmpR

CACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTG  >  minE/2685287‑2685347 |                                                             cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:290168/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:792063/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:745995/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:705406/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:622859/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:534085/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:533027/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:430375/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:3264485/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:3142115/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:3076477/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:1004629/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:289329/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:2862691/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:2757792/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:2628023/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:2477259/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:2295188/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:1982497/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:1865690/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:1185102/61‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTg  <  1:1126096/61‑1 (MQ=255) |                                                             CACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGCGATTTTG  >  minE/2685287‑2685347

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑