Missing coverage evidence...
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GGGGAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACAAGGAAG  >  minE/2699578‑2699639 |                                                              ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:3190020/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2676914/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2720206/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2728058/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2742417/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2761127/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2961864/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2962732/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2989065/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:3055735/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:3058746/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2597449/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:3272229/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:406766/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:468304/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:496000/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:543581/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:543813/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:552423/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:600009/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:608030/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:696255/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2128090/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:1227004/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:1246210/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:146825/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:1606597/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:1696080/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:1747452/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:1992033/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2114105/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2122638/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2124506/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:1098926/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2151985/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2191562/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2347326/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:240766/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2463112/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2506385/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2509965/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2514219/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:253952/62‑1 (MQ=255) ggggAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACaaggaag  <  1:2542726/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGGGAGCCACGCAGCAGGATGCGCAGGGACGCTGGCAATTTGAGTATCAGTTAACAAGGAAG  >  minE/2699578‑2699639

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑