Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2716562	2716567	6	13 [0]	[0] 24	ppiA	peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase A

GCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCG  >  minE/2716568‑2716629 |                                                              gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1330224/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:59691/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:578765/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:514567/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:416594/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:358865/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:2954193/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:2832866/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:2769625/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:2670471/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:2613694/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:2293050/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:2077841/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:2045653/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1990917/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1930712/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1846384/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:176589/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1678664/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1439176/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1360033/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1341719/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:1179597/62‑1 (MQ=255) gCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGGCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCg  <  1:757746/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCCGACTCATGACGTTGGTCCGTACCAGAATGTGCCGTCAAAACCGGTAGTTATCCTTTCCG  >  minE/2716568‑2716629

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑