Missing coverage evidence...
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TTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACG  >  minE/2731967‑2732027 |                                                             ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCTGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:160929/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACTGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:856491/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:483474/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:2624714/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:3110567/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:3114422/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:3152325/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:3220159/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:3265620/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:3275764/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:401388/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:475345/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:2447652/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:516156/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:619646/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:669316/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:76543/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:913820/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:972937/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1847552/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1168633/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1211734/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:121736/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1286949/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1394604/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:139575/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:168253/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1754998/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:2609146/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:191480/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1923266/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1942830/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1998671/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:221981/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:226403/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACg  <  1:1110465/61‑1 (MQ=255) ttGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCCACg  <  1:2259039/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTGGATTTACTGGATCAACGTCCTTTCGACCAGACCGATTTTGATATTCTGAAATCCTACG  >  minE/2731967‑2732027

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑