Missing coverage evidence...
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GACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGA  >  minE/2735835‑2735896 |                                                              gACCTGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2001824/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:3167310/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:3117461/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:3215133/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:3256419/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:349258/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:389781/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:401692/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:44/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:520961/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:526890/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:65495/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:727175/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:775854/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:79168/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:830925/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:88430/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:924498/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:945182/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2049856/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1324872/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1495740/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1701404/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1702217/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1710548/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1798609/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1855911/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1887322/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:1121049/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2167924/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2475947/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2479593/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2600555/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2602348/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2685524/62‑1 (MQ=255) gACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGa  <  1:2713749/62‑1 (MQ=255) |                                                              GACCCGTTTGTTGGTAACCTGACCTTCTTCCGTGTTTACTCCGGTGTGGTTAACTCTGGTGA  >  minE/2735835‑2735896

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑