Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2777887 2777899 13 78 [0] [1] 112 arpA/iclR regulator of acetyl CoA synthetase/DNA‑binding transcriptional repressor

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

ATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTC  >  minE/2777899‑2777959
 |                                                           
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2871824/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:432433/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:429359/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:426243/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:414919/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:39364/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:354601/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:347292/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:331020/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:3215775/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:3205650/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:3029175/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2880040/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:462870/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2827034/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2781274/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2771814/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2760632/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2718159/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2677887/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2637613/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2624663/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:261655/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2598878/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2569511/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:844532/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:9906/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:972943/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:971672/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:97077/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:956503/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:948725/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:937310/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:929404/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:895531/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:886103/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:874150/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:861241/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2563234/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:775804/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:76045/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:724135/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:685244/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:677165/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:668441/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:619774/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:585542/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:564254/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:562854/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:482544/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1345789/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1720271/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1683553/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1681445/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1675013/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1673415/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:159000/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1583482/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1496858/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1421284/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1414357/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1385420/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1365380/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1736298/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:133217/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1299837/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1258379/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1240714/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1212793/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1154046/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1123258/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1086983/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1082922/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1082706/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1071445/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:209524/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2524997/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2503836/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2487128/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2484711/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2368651/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2351392/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2348910/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2346112/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:227991/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2277532/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2236106/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2138655/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1051373/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2068675/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2063060/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:2029308/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1976603/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1971406/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:193300/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1931173/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1889894/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1843926/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1776102/60‑1 (MQ=255)
 tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTc  <  1:1752816/60‑1 (MQ=255)
 |                                                           
ATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTC  >  minE/2777899‑2777959

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑