Missing coverage evidence...
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ACAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCA  >  minE/2783773‑2783832 |                                                            aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGCTGGCACGGTTTTGCa  <  1:3015941/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1078859/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1875622/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1901772/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:2033186/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:22574/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:2388071/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:2442848/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:2473206/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:266118/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:2741975/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:3056119/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:3114187/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:3136606/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:3198559/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:375114/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:508646/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:525386/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:673451/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1537251/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1099880/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1261090/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1263366/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1317119/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1337141/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1353258/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1466318/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1482649/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1834813/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1627296/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1672592/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1690159/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1734049/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1798465/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1826930/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGCTTTGCa  <  1:2070511/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGTACGTTGCCTGGGCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1627608/60‑1 (MQ=255) aCAACCTTGCACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCa  <  1:1235357/60‑1 (MQ=255) |                                                            ACAACCTTGTACGTTGCCTGGTCATGCTGCCATTTGTTGACCCGATGGCACGGTTTTGCA  >  minE/2783773‑2783832

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑