Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2820745	2820759	15	20 [0]	[0] 48	nrfE	heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE

CTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTG  >  minE/2820760‑2820810 |                                                   ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCTACATAGCTATAGCctg  <  1:360088/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:3251992/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2716637/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2771893/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2785316/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2835628/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2867849/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2900280/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2959912/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2960462/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:3141540/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:3169121/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:3185128/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2714910/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:3287448/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:501808/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:512248/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:557540/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:593321/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:740500/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:765355/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:790171/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:902345/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:993545/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1584551/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1099668/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1196576/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1250031/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1354502/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1385130/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1404600/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1460727/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1461210/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:14804/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1549919/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1575837/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1061593/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:160778/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1717670/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1755461/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1794627/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1848319/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:1915339/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2035778/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2211101/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2272933/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2274763/51‑1 (MQ=255) ctcATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCctg  <  1:2680510/51‑1 (MQ=255) |                                                   CTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTG  >  minE/2820760‑2820810

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑