Missing coverage evidence...
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TGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTAAA  >  minE/2832688‑2832748 |                                                             tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGCCGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2858011/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAATTGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:582267/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2788916/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:956954/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:857381/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:786536/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:771205/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:347670/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:3207707/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:3046651/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:3017402/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:291357/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:1160339/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2664305/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2652618/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2649881/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:255726/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2527711/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2507194/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2389889/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2133204/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:2129349/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:1693674/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:147378/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTaaa  >  1:1279608/1‑61 (MQ=255) tGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCAGCGTaaa  >  1:3142408/1‑61 (MQ=255) |                                                             TGGCAGCTAAAGACGTAAAATTCGGTAACGACGCTCGTGTGAAAATGCTGCGCGGCGTAAA  >  minE/2832688‑2832748

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑