Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2838742	2838744	3	57 [0]	[0] 29	sugE	multidrug efflux system protein

CGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTG  >  minE/2838745‑2838806 |                                                              cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAAccc                     >  1:562895/1‑43 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGGGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1907376/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGt     >  1:1792839/1‑59 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:2185036/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:981953/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:902512/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:807515/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:661958/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:518417/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:3220923/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:284135/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:2771825/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:2764199/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:272179/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:2617520/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:2571324/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:2470517/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1085619/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:2090323/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:2081637/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1959703/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1876405/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1514119/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1446496/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1402926/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1303915/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1288494/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1227431/1‑62 (MQ=255) cgGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTg  >  1:1152030/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTG  >  minE/2838745‑2838806

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑