Missing coverage evidence...
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GTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCA  >  minE/2838938‑2838999 |                                                              gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAg                            >  1:60207/1‑36 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:1317566/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:685784/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:2698377/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:415044/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:402197/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:1723382/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:1973473/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:268224/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:338212/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:1023127/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:299054/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAAcc   >  1:2242848/1‑61 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2941326/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:3134302/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2849864/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2829880/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2945182/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2949084/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2991463/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2649691/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:342885/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:680871/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:819331/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2809510/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2615385/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:260718/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:239668/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2303053/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2249188/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2141712/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2106434/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2082756/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:2066309/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:1532501/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:1495235/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:1485401/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:1483877/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:1452715/1‑62 (MQ=255) gTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCa  >  1:117788/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTCAGAAATGGTTGGCGTGCGGGAGAGTATCCACAGGTAGTCGCGGTCCGGGCCGCAAACCA  >  minE/2838938‑2838999

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑