Missing coverage evidence...
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TCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTGTA  >  minE/2851829‑2851890 |                                                              tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCTGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1475934/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGATCTTgta  <  1:1675608/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:2654688/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:2396592/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:2666822/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:2719885/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:3019874/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:3024257/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:3147738/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:3203968/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:321532/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:357250/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:416485/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:537905/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:581944/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:624403/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:674794/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:765252/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:779921/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:928255/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1704757/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1084870/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1249668/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1348433/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:137432/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1386429/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1402285/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1408653/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1613177/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:2507891/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1708624/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1868857/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1879134/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:2134798/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:2269070/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:2335902/62‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTgta  <  1:1032735/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCGTTAAAGGTGCGGTAGCTGGCGGTGTCCGGCTTTTGCGCCTCTTTCATGTCGACCTTGTA  >  minE/2851829‑2851890

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑