Missing coverage evidence...
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AGAGATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAACGC  >  minE/2870136‑2870197 |                                                              agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2430376/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:929545/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:491177/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:44984/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:3217996/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:3121811/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:3119038/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:3041278/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:287547/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2706968/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2556726/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2529772/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2480213/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2446336/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1007260/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2300082/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2272368/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:2078530/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1929736/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1866922/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:181799/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1351240/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1309672/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1300241/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1260467/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1163872/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcgc  >  1:1085211/1‑62 (MQ=255) agagATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAAcg   >  1:2262558/1‑61 (MQ=255) |                                                              AGAGATGCTGCAACTGGGTCAGCACTGTTCGATGGCGGAACGTCGTGCCGACGAAGCAACGC  >  minE/2870136‑2870197

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑