Missing coverage evidence...
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CGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTCA  >  minE/2924116‑2924178 |                                                               cGGTCGCCGTAAGGCACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:1316720/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAAtt                          >  1:1227565/1‑39 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGGCa           >  1:754145/1‑54 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCTAGCGCGTc   >  1:1661974/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:880454/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:87771/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:745226/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:56906/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:48483/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:4672/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:437158/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:31972/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:2927003/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:2794604/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:2735737/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:2568342/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:2527693/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:2111691/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:2050277/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTc   >  1:1397740/1‑62 (MQ=255) cGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGG‑CAAGCGCGTCa  >  1:1114963/1‑62 (MQ=255) cGGGCGCCGTAAGGACCGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCccgcag               >  1:2234998/1‑50 (MQ=255) |                                                               CGGTCGCCGTAAGGAACGGTCAGGTCGTGCGGTTTAATTTCTTCCAGCAGGCCAAGCGCGTCA  >  minE/2924116‑2924178

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑