Missing coverage evidence...
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TCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCTGGTGG  >  minE/2940009‑2940070 |                                                              tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCTCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:134278/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGa                         >  1:536059/1‑39 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTc              >  1:782643/1‑50 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:3009808/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:809961/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:636888/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:607584/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:468462/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:3285731/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:3279781/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:277295/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:2673001/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:1116726/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtgg  >  1:1106177/1‑62 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtg   >  1:1091570/1‑61 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtg   >  1:3228003/1‑61 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtg   >  1:2422841/1‑61 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtg   >  1:1559022/1‑61 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCtggtg   >  1:753252/1‑61 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCAAGCTTCATCGGCtggtg   >  1:1229296/1‑61 (MQ=255) tCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGACGTTGAGCGCCAGCTTCAt            >  1:2834924/1‑52 (MQ=255) |                                                              TCAGGCTGGCCCAGCATGCAGAAAGCGCCACGCCGGTGAGCGCCAGCTTCATCGGCTGGTGG  >  minE/2940009‑2940070

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑