Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2968823	2968828	6	48 [0]	[0] 98	yjjJ	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

CCACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAC  >  minE/2968829‑2968890 |                                                              ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAAcag                         >  1:2965395/1‑39 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAAca                          >  1:1809071/1‑38 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAAc                           >  1:256589/1‑37 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAg        >  1:1926557/1‑56 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGaa   >  1:1162803/1‑61 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2629045/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:3104741/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:3081543/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:3020191/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2981592/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:297437/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2897312/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2846757/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2813532/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2770721/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:3211867/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2592827/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2587658/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2546694/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2529621/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2515514/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2453702/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2442162/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2399187/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2394386/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2322735/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:519347/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:941197/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:859232/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:838776/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:835617/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:735841/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:724282/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:703519/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:616236/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:613307/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:600030/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:54685/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:529159/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:3109492/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:513770/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:482867/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:457842/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:449342/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:382414/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:379749/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:342945/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:3257361/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:3256266/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:3214371/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2266301/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:130468/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1619918/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1579490/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1578065/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1570715/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1529951/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1473645/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1461997/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1450559/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1423394/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:138308/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1338769/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1685289/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1231202/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1229378/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1164308/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1132982/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1086266/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1060331/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:103534/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1017899/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:101234/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1007520/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1938516/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1006052/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:21789/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2139148/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2133762/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2082259/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2026279/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2018762/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2018576/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2005774/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1949250/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1939223/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:2270555/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1895919/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:187943/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1867965/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1860188/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1834721/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1771671/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1747935/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1728648/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1725196/1‑62 (MQ=255) ccACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGAGGAAc  >  1:164910/1‑62 (MQ=255) ccACGCAATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAc  >  1:1884754/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCACGCCATCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAAC  >  minE/2968829‑2968890

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑