Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2973796	2973817	22	6 [0]	[0] 59	nadR	bifunctional DNA‑binding transcriptional repressor and NMN adenylyltransferase

AAGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTA  >  minE/2973818‑2973854 |                                     aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCtt   >  1:1062621/1‑36 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCtt   >  1:2058543/1‑36 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2475612/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:989892/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2496887/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2567351/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2617752/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2631974/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2688794/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2732133/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2771362/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2806303/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2826255/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2867054/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:293924/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:3007307/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:3217167/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:3220892/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:410402/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:448326/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:502343/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:679348/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:701229/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:74579/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:757501/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:805103/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:8189/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:883753/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:907832/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:930117/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1004581/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1837691/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1096120/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1149609/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1151431/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1235437/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1238385/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1279924/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:130871/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1374590/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1390591/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:148673/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:154631/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1687830/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:1746234/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2410328/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:187892/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:195910/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:196484/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2003709/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2233417/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2237013/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2277658/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2281771/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:22879/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2306316/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:231251/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTa  >  1:2326657/1‑37 (MQ=255) aaGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACATTa  >  1:2156684/1‑37 (MQ=255) |                                     AAGTTCTACCCACTGCATACCGGACATATCTACCTTA  >  minE/2973818‑2973854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑