Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2978399	2978409	11	16 [0]	[0] 14	slt	lytic murein transglycosylase, soluble

CGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCTT  >  minE/2978410‑2978471 |                                                              cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:1058532/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:1366704/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:1455811/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:1478969/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:1769879/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:1851266/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:2058908/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:2242654/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:3050506/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:3266754/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:3276766/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:49067/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCtt  >  1:537532/1‑62 (MQ=255) cGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCt   >  1:3002191/1‑61 (MQ=255) |                                                              CGATCGCCGGGAAGCTGTGGGATCATCTGGAAGAGCGATTCCCGCTGGCTTACAACGATCTT  >  minE/2978410‑2978471

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑