Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2981650	2981664	15	26 [0]	[0] 83	rob/creA	DNA‑binding transcriptional activator/conserved hypothetical protein

GCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATAA  >  minE/2981665‑2981726 |                                                              gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAg                  >  1:728627/1‑46 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGaaa     >  1:1018138/1‑59 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGaaa     >  1:1226048/1‑59 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGaaa     >  1:3164637/1‑59 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGaaa     >  1:43842/1‑59 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGa       >  1:1110529/1‑57 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGa       >  1:2065548/1‑57 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGa       >  1:3036429/1‑57 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGa       >  1:1593886/1‑57 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2974785/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:887976/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:3097943/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:3073377/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:970445/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:997916/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:3032400/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:3023351/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:298203/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:3239150/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:288237/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2872481/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2853239/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2833222/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2755691/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2721020/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2720431/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2689811/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:48236/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:705941/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:635574/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:62045/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:614186/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:610287/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:599132/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:557712/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:526032/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:733346/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:471179/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:443211/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:764118/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:847476/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:437256/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:360530/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:3265129/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1430125/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2594579/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1638349/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1584337/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1564184/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1558294/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1539215/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1516597/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1491938/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1471424/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1677016/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1403733/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1372877/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:133657/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:131858/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1315943/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1259528/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1153649/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1119742/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1693986/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2525306/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2469324/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2439758/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2347223/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2221943/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2177075/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2138707/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2132090/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:2060451/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1992701/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1988766/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1709155/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1695805/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAAt    >  1:1685725/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATaa  >  1:1418600/1‑62 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATaa  >  1:24969/1‑62 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATa   >  1:1242199/1‑61 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGAAGGAAAt    >  1:2283139/1‑60 (MQ=255) gCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATATTTTAGGGCTTGACGGaaa     >  1:2180016/1‑59 (MQ=255) |                                                              GCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATAA  >  minE/2981665‑2981726

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑