Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	278924	278937	14	81 [0]	[0] 47	cyoB	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I

CCGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGA  >  minE/278938‑278998 |                                                             ccGAGGCGTTTATGGTCGCCGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:549414/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTAc     >  1:202502/1‑58 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCg   >  1:2398379/1‑60 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:3088449/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2626791/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2671220/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2718941/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2768961/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:283089/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2860628/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2929376/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2946601/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:3014571/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:3031761/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2590969/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:353110/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:357177/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:396785/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:541865/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:553171/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:567728/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:695135/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:794345/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:85477/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:910417/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:10097/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1051200/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:116519/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1276762/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1370902/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1420955/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1510210/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1521422/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1681950/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1742847/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1920359/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:194059/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2053863/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:225319/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2309050/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2400335/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2425772/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2501341/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2565672/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:2623805/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACACTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1829710/1‑61 (MQ=255) ccGAGGCGTTTAAGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGa  >  1:1617497/1‑61 (MQ=255) |                                                             CCGAGGCGTTTATGGTCGACGGAGGTCAGCCACTCTTTCCACAGGTAGGTCCACTTACCGA  >  minE/278938‑278998

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑