Missing coverage evidence...
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CCGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATG  >  minE/311258‑311319 |                                                              ccGTACTGCGCAGAATACTGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1426250/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:577978/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2143527/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:219383/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2272049/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2325658/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2433204/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2659183/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:271293/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2934027/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:3029481/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2098455/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:582694/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:658800/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:679458/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:695708/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:715977/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:7294/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:792739/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:805520/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:990893/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1409620/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1079938/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1092414/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:114182/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:119142/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1198748/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1219250/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1235672/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1296402/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:139388/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1078137/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1519955/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:155325/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1635788/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1657865/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1807312/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:1888762/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2004544/62‑1 (MQ=255) ccGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATg  <  1:2079221/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCGTACTGCGCAGAATACCGCCTACGCTGTCGGTGTAGTGGTGCGTGCTCTTCTCGAACATG  >  minE/311258‑311319

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑