Missing coverage evidence...
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GCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCA  >  minE/332606‑332666 |                                                             gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCgccgcc   >  1:449914/1‑60 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:1634843/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:808184/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:784008/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:593335/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:494035/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:3184974/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:2814092/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:2772851/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:2537814/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:225291/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:2224123/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:2188790/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:2098030/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:2050152/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:2023414/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:1951232/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:1938352/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:1930681/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:1907348/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:1839954/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:1276389/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCAACGCCGCCa  >  1:2462696/1‑61 (MQ=255) gCCGCAAGCACAAACCAGGCAAAGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCa  >  1:850425/1‑61 (MQ=255) |                                                             GCCGCAAGCACAAACCAGGCAACGTTGCCTTTGCCATAAGGCGCGATAATCACCGCCGCCA  >  minE/332606‑332666

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑