Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	358621	358628	8	33 [0]	[0] 92	sfmC	pilin chaperone, periplasmic

CCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACC  >  minE/358629‑358690 |                                                              ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGGGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:3254798/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGTAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2108495/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:280087/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:3178985/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:3177703/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:3093697/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2986866/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2931278/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2890250/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2879655/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2875105/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2844425/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:3211361/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2780577/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2775764/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2738059/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2716809/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2660453/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2634296/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2531911/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2528503/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2440706/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1025196/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:724229/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:991362/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:918744/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:88457/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:860816/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:821489/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:819887/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:815247/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:793155/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:768069/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:758858/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:319345/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:700093/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:697045/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:54634/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:495643/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:413759/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:358212/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:3294509/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:3281724/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:323454/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2433570/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:155222/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1849087/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1839709/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1812333/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1728618/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1724763/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1664222/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1645148/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1585199/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1579310/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1571548/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1566400/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1863083/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1497291/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1321259/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:127727/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1247058/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:123632/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1226317/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1203955/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1166807/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1148222/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1092230/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1054068/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2193050/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2407719/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2405745/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2393092/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2350821/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2295245/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:229041/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2280496/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2241820/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2230482/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:22020/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2428676/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2152284/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2074388/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2070890/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:203383/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:2000510/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1914748/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1914734/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:1866875/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTAAGAcc  <  1:2739581/62‑1 (MQ=255) ccAGAGTTAAATCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:315216/62‑1 (MQ=255) ccACAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc  <  1:3150791/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACC  >  minE/358629‑358690

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑