Missing coverage evidence...
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ACTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACT  >  minE/432619‑432679 |                                                             aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGGCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2540575/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAAcc           >  1:443530/1‑52 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGAc   >  1:460596/1‑60 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2998484/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2610190/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2625994/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2686646/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2702906/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2853543/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2866202/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2912770/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2968515/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2460611/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:3296496/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:460343/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:774302/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:787801/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:972119/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:995005/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1603868/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1088732/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1188460/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1210763/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1434783/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1463851/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1491110/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1495010/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1556964/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1027225/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1616339/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1739552/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1932715/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2045598/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2051918/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2099641/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2325759/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:2355838/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTCATCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:1750728/1‑61 (MQ=255) aCTCCAACCTACGCTTACTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACt  >  1:608295/1‑61 (MQ=255) |                                                             ACTCCAACCTACGCTTCCTCAAACGGTCGCCTGGATATCTGGTGGGATAACCGTTCTGACT  >  minE/432619‑432679

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑