Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	446701	446722	22	26 [0]	[0] 29	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

ATAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGCC  >  minE/446723‑446779 |                                                         aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGaaa                     >  1:2538764/1‑38 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGGAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:2897187/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCg            >  1:2899840/1‑47 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGtctc        >  1:1919204/1‑51 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGtc          >  1:3104676/1‑49 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCgcgc   >  1:2350706/1‑56 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:868050/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1044910/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:848159/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:60578/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:568509/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:497186/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:46410/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:385952/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:3274631/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:3235564/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:2823936/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:2608317/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:2185353/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:2143535/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:2024245/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1962100/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1703519/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1674737/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1593593/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1394491/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1320076/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1209344/1‑57 (MQ=255) aTAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGcc  >  1:1155968/1‑57 (MQ=255) |                                                         ATAACGCACTACCGCTTTCTCTTCCGCTGGATCAGAAAGTGTTGCCGTCTCCGCGCC  >  minE/446723‑446779

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑