Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	478922	478950	29	2 [0]	[0] 36	cydA	cytochrome d terminal oxidase, subunit I

ATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGC  >  minE/478951‑479012 |                                                              aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGaaa                            >  1:1498085/1‑36 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATg   >  1:79469/1‑61 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2820334/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:802318/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:301963/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:3099170/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:3213026/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:3256841/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:325947/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:3265429/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:3265668/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:33985/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:35008/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:435435/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:474837/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:497713/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:58794/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:645269/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:1134777/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2101948/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:1527123/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:1557982/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:1798769/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:1814532/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:1828300/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:1875888/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:1948005/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2073720/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2816517/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2185256/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2218967/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2221166/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2752423/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2755111/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2776654/1‑62 (MQ=255) aTGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGc  >  1:2806626/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGC  >  minE/478951‑479012

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑