Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	479080	479085	6	86 [0]	[0] 84	cydA	cytochrome d terminal oxidase, subunit I

ATCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAT  >  minE/479086‑479147 |                                                              aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTTGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2248689/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2887775/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:3151144/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:3135590/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:3114935/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:3083928/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:307866/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:3068420/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:3015733/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:295447/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2910679/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2890374/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:3175848/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2874147/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2751435/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2750496/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2735688/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2672272/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2506/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2484424/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:245602/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2406556/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:704132/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:960538/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:945480/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:940924/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:897346/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:864868/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:833233/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:831283/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:830369/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:793964/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:773138/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2328424/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:584486/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:579670/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:526291/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:523897/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:494420/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:469100/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:454530/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:390495/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:386594/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1279922/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1628297/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:158760/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1573150/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1563511/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:152298/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1490324/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1480478/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1469576/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1304472/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1296796/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:168504/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1269784/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1265898/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1262092/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1220287/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1217560/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1120622/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1090492/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1072571/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1011121/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1918199/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2316378/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2308683/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2281212/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2057313/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2031567/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2031158/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1956241/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1006003/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1887385/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1883407/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1881612/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1863433/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1825170/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1819643/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1800449/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1792675/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:174295/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATAATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:1929/62‑1 (MQ=255) aTCATGGTGGCGTGTGACTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAt  <  1:2080545/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATCATGGTGGCGTGTGGCTTCCTGCTTCTGGCAATCATCGCGCTCTCTTTCTGGAGTGTCAT  >  minE/479086‑479147

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑