Missing coverage evidence...
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CGCGCTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAC  >  minE/495592‑495654  |                                                              cgcgcT‑GCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2284142/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACTGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1240530/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2666021/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:956947/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2773431/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2777899/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2779319/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2786418/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2811952/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2895757/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2938056/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:3004199/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:3004836/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:30271/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:3082485/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:330369/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:487951/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:510773/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:536305/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:577126/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:584987/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:587228/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:779482/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:881787/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:900361/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:949226/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2497382/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1323450/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1464062/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1565949/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:156641/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1633282/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1663916/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1704576/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1844088/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1941006/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1959619/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:1977402/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2064613/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2124052/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2145411/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2145799/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2146190/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2221172/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2269717/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2349925/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2362467/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2401579/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:2631716/62‑1 (MQ=255)  gcgcTGGCAGCTTCAACGGTGCAGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAc  <  1:124020/62‑1 (MQ=255)  |                                                              CGCGCTGGCAGCTTCAACGGTGCGGGCGTTTTCAGTCAGTATATGACGCACGCGTTTTGCCAC  >  minE/495592‑495654

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑