Missing coverage evidence...
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GTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTC  >  minE/508562‑508623 |                                                              gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc                        >  1:1706594/1‑40 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGt                    >  1:835195/1‑44 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGtt   >  1:1311725/1‑61 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGtt   >  1:3211519/1‑61 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:833469/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:750572/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:673302/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:672395/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:636140/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:563478/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2606043/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:506979/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:425140/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:394649/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:376906/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:3247550/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:312556/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2884327/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2658750/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:1042719/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2561944/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2388437/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2329020/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2289660/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2233530/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2148404/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:2052789/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:1660707/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:1474692/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:1358960/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:1337040/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:11739/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:1139733/1‑62 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtc  >  1:1134049/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTC  >  minE/508562‑508623

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑