Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	558817	558831	15	7 [0]	[0] 10	cmr	multidrug efflux system protein

TTTTCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAAT  >  minE/558832‑558892 |                                                             ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCgt             >  1:515790/1‑50 (MQ=255) ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:1059417/1‑61 (MQ=255) ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:1383306/1‑61 (MQ=255) ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:164800/1‑61 (MQ=255) ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:2371820/1‑61 (MQ=255) ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:2444638/1‑61 (MQ=255) ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:2999061/1‑61 (MQ=255) ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:728737/1‑61 (MQ=255) ttttCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:807222/1‑61 (MQ=255) ttttCAACATATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAat  >  1:947745/1‑61 (MQ=255) |                                                             TTTTCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGTGGAACAAT  >  minE/558832‑558892

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑