Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	558905	558921	17	6 [0]	[0] 42	cmr	multidrug efflux system protein

TCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCG  >  minE/558922‑558981 |                                                            tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGTCCGCTGTCg  <  1:159214/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:501100/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:3003742/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:3025638/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:3049573/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:3088495/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:3089447/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:3210497/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:3218206/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:3257298/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:360423/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:439147/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2765873/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:550275/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:556171/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:621560/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:622128/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:6965/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:710910/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:713562/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:890903/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:981472/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1813157/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1166607/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1250080/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1260642/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1401353/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:151181/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1534575/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1551727/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:166647/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:17850/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1155956/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:1874284/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2034465/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2142847/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2168895/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2392449/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2425500/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2548500/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2702148/60‑1 (MQ=255) tCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCg  <  1:2730957/60‑1 (MQ=255) |                                                            TCGATGACCGCGTATCTGGCGGGCGGGATGTTTTTACAATGGCTGCTGGGGCCGCTGTCG  >  minE/558922‑558981

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑