Missing coverage evidence...
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GCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGA  >  minE/594185‑594246 |                                                              gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGTGa  <  1:2267085/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:3201264/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2521470/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:263248/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2771806/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2789672/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2850454/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:28542/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2861796/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:293558/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2993294/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:3054396/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:3088372/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2446814/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:3279916/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:349247/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:459055/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:52269/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:547132/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:602993/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:6656/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:715170/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:780729/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:942257/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:977851/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1847037/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1116312/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1240947/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1411349/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1440216/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1463654/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1523632/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1538354/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1573566/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1592844/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1689024/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1782339/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1061509/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1858845/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:1922816/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2143859/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2190287/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2216823/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2235639/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2361022/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2363772/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGa  <  1:2408051/62‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGGCAGGGCGa  <  1:2120343/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCCAGCTTCACACAAAAAGTGACTGACGGTAGCGGCGCGGCGGTGCAGGAAGGTCAGGGCGA  >  minE/594185‑594246

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑