Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	595819	595873	55	12 [0]	[0] 31	ycaJ	recombination protein

TGAAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCT  >  minE/595874‑595935 |                                                              tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCTCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:870240/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCTGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:317412/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAGTAGCACAAACACGCt  >  1:157118/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATATCACAAACACGCt  >  1:624853/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGc   >  1:2348365/1‑61 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGc   >  1:1193464/1‑61 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGc   >  1:2690167/1‑61 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:2542117/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:988790/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:2758871/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:2789943/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:3123013/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:3154788/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:3244115/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:704559/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:764351/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:1077436/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:2451833/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:2249051/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:2199907/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:1987547/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:1784529/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:1518476/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:1326391/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:1302096/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:126837/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:112789/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:1123813/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:1119319/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGACGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:2067848/1‑62 (MQ=255) tgaAGCAAACGCTTATGCTGCCGATGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCt  >  1:3175606/1‑62 (MQ=255) |                                                              TGAAGCAAACGCTTATGCTGCCGGTGAGGTTTACTTCCCGCCGGAAATAGCACAAACACGCT  >  minE/595874‑595935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑