Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	616407	616419	13	3 [0]	[0] 64	aroA	5‑enolpyruvylshikimate‑3‑phosphate synthetase

ATTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTATT  >  minE/616420‑616481 |                                                              aTTGATATGGATATGAACCATATTCGTGATGCGGCGATGACCATTGcaa               >  1:1371479/1‑47 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2816733/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:326629/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:3073822/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:3035671/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2962102/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2959905/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2885825/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2825323/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:3279015/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2795505/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2731576/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2725230/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2702565/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2644352/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2632810/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2624022/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1038230/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:3295046/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:369495/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:394659/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:395773/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:439470/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:450269/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:512670/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:531688/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:563828/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:689483/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:853122/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:910335/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:913423/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:972641/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:240323/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1022984/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1084392/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:11244/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1185590/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1225680/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:134994/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1351815/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1352753/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1446161/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1510660/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1564155/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1612685/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1660382/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1708753/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:248802/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2341089/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2337189/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2334472/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2205793/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2079052/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2060007/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:2015376/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1954843/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1824434/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1794649/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:1735159/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAtt  >  1:168287/1‑62 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAt   >  1:1603535/1‑61 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAt   >  1:1111114/1‑61 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTAt   >  1:997492/1‑61 (MQ=255) aTTGATATGGATATGAACCATATTACTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTa    >  1:716705/1‑60 (MQ=255) |                                                              ATTGATATGGATATGAACCATATTCCTGATGCGGCGATGACCATTGCCACGGCGGCGTTATT  >  minE/616420‑616481

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑