Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	31991	31995	5	35 [0]	[0] 72	caiF	DNA‑binding transcriptional activator

GAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGC  >  minE/31996‑32057 |                                                              gAAAAACCTCTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:3114706/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGTGTGATAGc  <  1:1735586/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2841339/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:3051469/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:3040492/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:3022272/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2958608/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2910222/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2845490/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:3137102/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2828028/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:279518/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2782401/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2778688/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:27770/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:261398/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2598857/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:253335/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:485978/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:98337/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:709630/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:615008/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:599765/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:559660/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:556049/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:538700/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:527819/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2492731/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:462303/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:451306/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:386191/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:346901/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:344739/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:3289770/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:3222394/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:3139808/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1330195/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1643189/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1616982/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1558370/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1551788/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1539421/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1481701/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1462233/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1402687/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:167254/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1321628/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1302078/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1288035/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1279884/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1277396/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1249538/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1201601/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1041008/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2137106/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2396335/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2308538/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2283816/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2225260/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2168600/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2165122/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1006616/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2081025/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1956089/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1891449/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1883079/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1862249/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1792271/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1684479/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:1683364/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACTTGTTAACCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2334674/62‑1 (MQ=255) gAAAAACCACTCTACCTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGc  <  1:2823874/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGC  >  minE/31996‑32057

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑