Missing coverage evidence...
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CATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCATTTAT  >  minE/33894‑33952 |                                                           cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGtt                    >  1:318362/1‑41 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:2734144/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:97078/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:775976/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:661478/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:542523/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:521627/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:407461/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:3200992/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:3101907/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:3061224/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:3060442/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:2870569/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1081932/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:2683764/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:2459944/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:2443658/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:2313931/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:226165/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1998967/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1857953/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1817626/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1778500/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1735952/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1686252/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1676243/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1504948/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:1170987/1‑59 (MQ=255) cATATTGTTTTAGAATGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCatttat  >  1:3280073/1‑59 (MQ=255) cATAATGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTc                   >  1:651792/1‑42 (MQ=255) |                                                           CATATTGTTTTAGAGTGTGATTATTAGCTGGCAGGGTAGTTCCCTGCTGTTTCATTTAT  >  minE/33894‑33952

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑