Missing coverage evidence...
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TTTCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAC  >  minE/666040‑666101 |                                                              tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:2828335/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:975437/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:942548/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:895535/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:891302/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:700148/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:356033/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:348542/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:3167566/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:3146858/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:3140129/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:3074705/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:2853405/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:1258244/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:271423/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:2708455/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:2691733/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:2674932/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:2551274/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:2435922/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:217292/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:207272/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:1991790/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:1918540/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:1834945/62‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAc  <  1:1645298/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTCTTGAAGTTACCGAATATAACGCTCACTTGTGGGTGAACCTGACGGATTATCTCGATAC  >  minE/666040‑666101

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑