Missing coverage evidence...
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ATACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGTT  >  minE/680962‑681023 |                                                              aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:3227699/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2657803/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2702425/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2873368/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2883215/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:3082463/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:3164864/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:3174219/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:3180536/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2619444/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:3236414/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:35712/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:42326/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:501705/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:728247/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:809458/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:933328/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:1965152/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:125862/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:1425638/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:1604990/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:162336/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:1631159/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:1713146/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:1743302/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:1845495/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:1164375/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2008096/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2021847/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2057302/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2191404/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2257673/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2343703/62‑1 (MQ=255) aTACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGtt  <  1:2558797/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATACTGACCAGAGTCGCCAACAGCCAGCCCAGAGTGGTGGCAAATCCGCCAAGCACAAAGTT  >  minE/680962‑681023

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑